Coronavirus: mutasi

dan Christiane Fux, editor medis Diperbarui pada

Maximilian Reindl belajar kimia dan biokimia di LMU di Munich dan telah menjadi anggota tim editorial sejak Desember 2020. Dia akan membiasakan diri dengan topik kebijakan medis, ilmiah dan kesehatan untuk Anda agar dapat dimengerti dan dipahami.

Lebih banyak posting oleh Maximilian Reindl

Christiane Fux belajar jurnalisme dan psikologi di Hamburg. Editor medis yang berpengalaman telah menulis artikel majalah, berita dan teks faktual tentang semua topik kesehatan yang mungkin sejak tahun 2001. Selain bekerja untuk, Christiane Fux juga aktif dalam prosa. Novel kriminal pertamanya diterbitkan pada 2012, dan dia juga menulis, mendesain, dan menerbitkan drama kriminalnya sendiri.

Lebih banyak posting oleh Christiane Fux Semua konten diperiksa oleh jurnalis medis.

Saat ini, varian delta dari Sars-CoV-2 menjadi perhatian khusus para ahli: tidak hanya tampaknya lebih menular, tetapi juga lebih berbahaya daripada tipe liar aslinya. Mutasi lain telah terbukti setidaknya lebih menular. Di sini Anda dapat mengetahui sifat apa saja yang dimiliki oleh berbagai mutasi virus corona, di mana mereka menyebar, dan mengapa vaksinasi masih melindungi dengan sangat baik.

Mutasi itu biasa

Munculnya varian virus baru bukanlah hal yang aneh: Virus - termasuk patogen Sars-CoV-2 - berulang kali secara acak mengubah materi genetiknya selama replikasi. Sebagian besar mutasi semacam itu tidak ada artinya. Tetapi beberapa bermanfaat bagi virus dan menang.

Dengan cara ini, virus dapat dengan cepat beradaptasi dengan lingkungan dan inangnya. Ini adalah bagian dari strategi evolusi mereka.

Namun, sementara itu, apa yang disebut "Variants of Concern" (VoC) telah muncul dengan Sars-CoV-2 - yaitu varian yang menjadi perhatian para ahli. Kesamaan mereka adalah bahwa mereka lebih menular daripada bentuk asli Sars-CoV-2.

Ini adalah empat varian berikut:

• Alpha: Garis, juga dikenal sebagai B.1.1.7, menyebar dari Inggris Raya.
• Beta: Garis, juga dikenal sebagai B.1.351, menyebar dari Afrika Selatan.
• Gamma: Garis, juga dikenal sebagai P.1, menyebar dari Brasil.
• Delta: Garis, juga dikenal sebagai B.1.617, menyebar dari India.

Variasi virus dikelompokkan ke dalam apa yang disebut clades atau garis - peneliti membuat semacam "silsilah keluarga virus corona". Setiap varian dicirikan menurut susunan genetiknya dan diberi kombinasi huruf dan angka. Apakah jenis virus tertentu lebih berbahaya atau tidak tidak dapat ditentukan dari penunjukan ini - ini hanya digunakan untuk pencatatan dan dokumentasi yang sistematis.

Omong-omong: Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) baru-baru ini menyarankan untuk memperkenalkan nama baru untuk varian Sars-CoV-2 yang paling penting. Menurut WHO, varian virus individu sekarang diberi nama dalam urutan menaik menurut alfabet Yunani.

Deskripsi baru, lebih sederhana dan, di atas segalanya, netral ini dimaksudkan untuk mencegah varian virus baru disamakan dengan lokasi deteksi pertama mereka. Ini untuk mencegah stigmata, diskriminasi dan prasangka yang tidak berdasar dan tidak berdasar secara ilmiah terhadap masing-masing negara dalam debat publik.

Yang paling disukai. Sebuah studi dari Skotlandia yang diterbitkan dalam jurnal bergengsi The Lancet menunjukkan bahwa risiko perawatan di rumah sakit untuk infeksi Delta dua kali lebih tinggi dari varian aslinya.

Apakah vaksinasi melindungi terhadap varian Delta?

Ya. BioNTech / Pfizer melindungi 79 persen terhadap penyakit terhadap Delta setelah dosis vaksinasi kedua dibandingkan dengan 92 persen terhadap varian alfa, yang awalnya terdeteksi di Inggris Raya. Setelah vaksinasi dengan AstraZeneca, perlindungan setelah dosis vaksinasi kedua adalah 60 persen dibandingkan dengan 73 persen.

Angka-angka ini berhubungan dengan program gejala ringan dan sedang. Seberapa baik vaksinasi melindungi terhadap penyakit parah dan kematian tidak diperhitungkan. Tetapi justru di sinilah peringkat perlindungan bisa jauh lebih baik.

Virus Delta - Fakta Imunologis

Varian delta dari coronavirus (B.1.617) pertama kali ditemukan di India. Ini menunjukkan tiga sub-varian dan menggabungkan beberapa perubahan karakteristik. Bundling seperti itu ditunjukkan untuk pertama kalinya dalam varian virus.

Di satu sisi, ini adalah perubahan protein lonjakan, yang dianggap sebagai "kunci" untuk sel manusia. Di sisi lain, B.1.617 juga menunjukkan perubahan yang dibahas sebagai (mungkin) lolos mutasi.

Secara khusus, B.1.617 menggabungkan mutasi yang relevan berikut ini:

Mutasi D614G: Dapat membuat virus corona lebih menular. Pemodelan awal menunjukkan bahwa B.1.617 ditransmisikan setidaknya semudah varian alfa yang sangat menular (B.1.1.7).

Mutasi T478K: Ini mengarah pada pertukaran asam amino treonin yang tidak bermuatan dengan lisin pada posisi 478, terprotonasi dalam kondisi fisiologis - dan dengan demikian bermuatan positif. Diasumsikan bahwa pertukaran asam amino ini mempengaruhi interaksi dengan reseptor ACE2. Para ahli menduga ini bisa memicu penyakit Covid-19 yang lebih parah.

Mutasi P681R: Para peneliti juga mengaitkan ini dengan kemungkinan peningkatan virulensi.

Mutasi E484K: Juga ditemukan pada varian beta (B.1.351) dan varian gamma (P.1). Diduga membuat virus kurang sensitif terhadap antibodi penetralisir yang sudah terbentuk.

Mutasi L452R: Hal ini juga dibahas sebagai kemungkinan lolosnya mutasi. Strain virus corona dengan mutasi L452R sebagian resisten terhadap antibodi tertentu dalam percobaan laboratorium.

Varian virus lain yang diketahui

Selain itu, varian virus Sars-CoV-2 tambahan dikembangkan yang berbeda dari tipe liar - tetapi para ahli saat ini tidak menghitungnya sebagai VOC. Strain virus ini disebut "Variants of Interest" (VOI) - yaitu varian dari minat tertentu.

Belum jelas apa dampak VOI yang muncul ini terhadap pandemi. Jika mereka menahan diri terhadap jenis virus yang sudah beredar, mereka juga dapat ditingkatkan ke VOC yang sesuai.

Varian minat tertentu

Menurut Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa (ECDC), VOI ini saat ini meliputi:

• Eta: terbukti di banyak negara (B.1.525)
• Iota: pertama kali ditemukan di AS di wilayah New York (B.1.526)
• Kappa: pertama kali ditemukan di India (B.1.617.1)
• Lambda: pertama kali ditemukan di Peru (c.37)

Selain itu, menurut ECDC, ada VOI lebih lanjut yang belum dijelaskan menurut nomenklatur WHO yang baru:

• B. 1.620 tidak diketahui asalnya.
• B. 1.621 pertama kali ditemukan di Kolombia.

Menurut informasi dari ECDC dan WHO, varian yang disebutkan sebelumnya seperti epsilon, zeta dan theta tidak lagi menjadi bagian dari VOI. Varian B.1.616 yang pertama kali terdeteksi di Prancis juga beredar cukup lama tanpa berdampak signifikan terhadap pandemi.

Varian dalam pengamatan

Apa yang disebut "Varian dalam pemantauan" (VUM) juga dalam fokus yang diperluas - namun, masih ada kekurangan data yang dapat diandalkan dan sistematis tentang hal ini. Sebagian besar waktu, hanya ada bukti keberadaan telanjang mereka. Mereka termasuk varian yang terjadi secara sporadis atau "dimodifikasi" - atau lebih baik dikatakan, dikembangkan lebih lanjut - keturunan dari mutasi yang sudah diketahui.

Menurut ECDC, VUM langka ini saat ini meliputi:

• B.1.427 dan B.1.429 - sebelumnya disebut sebagai Epsilon oleh WHO, sekarang diturunkan, pertama kali ditemukan di California.
• P.2 - sebelumnya disebut sebagai Zeta oleh WHO, sekarang diturunkan, pertama kali ditemukan di Brasil.
• P.3 - sebelumnya disebut sebagai theta oleh WHO, sekarang diturunkan, pertama kali ditemukan di Filipina.
• B.1.214.2, A.27, A.28, C.16 dan B.1.1.318 - varian yang tidak diketahui asalnya.
• Varian lain yang pertama kali terdeteksi di Afrika Selatan: B.1.351 + E516Q dan B.1.351 + P384L, C.1.2
• Varian lain yang pertama kali terdeteksi di Inggris Raya: B.1.1.7 + L452R dan B.1.1.7 + S494P, A.23.1 + E484K, AV.1, B.1.671.2 + K417N
• Varian lain yang pertama kali terdeteksi di AS: B.1.526.1, B.1.526.2
• Varian yang pertama kali terdeteksi di Rusia: AT.1
• Varian yang pertama kali terdeteksi di Mesir: C.36 + L452R
• Varian yang pertama kali terdeteksi di Meksiko: B.1.1.519

Meskipun sejumlah besar varian virus baru sekarang dikenal, ini tidak secara otomatis berarti ancaman yang lebih besar. Penilaian risiko belum dapat dilakukan pada saat ini. Pengaruh VUM ini pada proses infeksi (global) juga tidak dapat diperkirakan. Jadi apakah beberapa varian virus relevan atau berbahaya hanya dapat diklarifikasi dengan pengamatan lebih lanjut.

Seberapa berbahayakah mutasi virus corona?

Mutasi virus corona yang secara resmi diklasifikasikan sebagai "Varian Kekhawatiran", menurut pengetahuan terkini, lebih berbahaya daripada jenis virus corona liar. Mereka sangat menular dan perubahan yang sesuai (mutasi lolos) dapat meningkatkan infeksi sekunder.

Namun, penilaian umum apakah mutasi virus corona lain lebih berbahaya daripada patogen Sars-CoV-2 asli tidak mudah dilakukan. Ada kurangnya pengalaman dan database yang solid, terutama dengan varian yang baru muncul.

Apa yang dimaksud dengan kekuatan menular yang lebih tinggi?

Jika Sars-CoV-2 menjadi lebih menular, juga akan lebih sulit untuk menghentikan penyebarannya. Langkah-langkah yang sejauh ini berhasil menahan penyebaran mungkin tidak lagi cukup.

Jika, misalnya, nilai replikasi R untuk bentuk virus liar dikurangi menjadi 0,8 dan jumlah orang yang terinfeksi berkurang secara bertahap, virus yang sekitar 35 persen lebih menular akan menyebar lebih jauh dan menggerakkan rantai infeksi jika tindakan yang sama diambil.

Apa artinya ini bagi vaksin?

Tidak ada jawaban umum untuk ini. Kemungkinan efek perlindungan yang berkurang dari vaksin yang baru dikembangkan sedang ramai dibicarakan di kalangan spesialis. Sejauh ini, produsen vaksin dan penyelidikan awal telah memberikan kejelasan dalam hal ini.

Misalnya, Comirnaty menunjukkan dalam studi awal efektivitas yang sebanding terhadap varian alfa (B.1.1.7) dan varian beta (B.1.351). VaxZevria juga tampaknya memberikan perlindungan yang baik di B.1.1.7, tetapi efektivitas terhadap garis B.1.351 dapat dikurangi.

Sejauh mana vaksin lain dari Moderna dan Johnson & Johnson akan bertahan terhadap varian virus yang dimodifikasi belum diklarifikasi secara meyakinkan.

Seiring perkembangan virus, penyesuaian vaksin mungkin diperlukan. Namun, karena kemajuan dalam pengembangan vaksin, ini dapat dilakukan dalam waktu singkat. Namun, semua vaksin yang disetujui di Uni Eropa masih memberikan perlindungan yang efektif dan memadai - terutama terhadap perjalanan Covid-19 yang parah dan fatal.

Informasi lebih lanjut tentang masalah vaksin virus corona dapat ditemukan di sini.

Seberapa cepat Sars-CoV-2 bermutasi?

Di masa depan, Sars-CoV-2 akan terus beradaptasi dengan sistem kekebalan manusia dan populasi yang divaksinasi (sebagian) melalui mutasi. Seberapa cepat ini terjadi sangat tergantung pada ukuran populasi yang terinfeksi secara aktif.

Semakin banyak kasus infeksi - regional, nasional, dan internasional - semakin banyak virus corona berlipat ganda - dan semakin sering terjadi mutasi.

Namun, dibandingkan dengan virus lain, virus corona bermutasi relatif lambat. Dengan total panjang genom Sars-CoV-2 sekitar 30.000 pasangan basa, para ahli mengasumsikan satu hingga dua mutasi per bulan. Sebagai perbandingan: Virus influenza bermutasi dua hingga empat kali lebih sering dalam periode yang sama.

Bagaimana saya bisa melindungi diri saya dari mutasi virus corona?

Anda tidak dapat secara khusus melindungi diri Anda dari mutasi virus corona individu - satu-satunya pilihan adalah tidak terinfeksi.

Sebagai aturan umum, patuhi aturan kebersihan, jaga jarak, dan kenakan masker FFP2 di tempat umum. Jika Anda divaksinasi, Anda juga akan menikmati kekebalan dasar yang baik terhadap kursus yang parah.

Bagaimana mutasi virus corona ditemukan?

Jerman memiliki sistem pelaporan yang erat untuk memantau virus Sars-CoV-2 yang beredar - ini disebut "sistem pengawasan molekuler terintegrasi". Untuk tujuan ini, otoritas kesehatan terkait, Institut Robert Koch (RKI), laboratorium diagnostik khusus, dan laboratorium konsultasi untuk virus corona di Berlin Charité bekerja sama secara erat.

Bagaimana cara kerja sistem pelaporan jika diduga ada mutasi?

Pertama-tama, setiap tes virus corona positif yang dilakukan secara profesional wajib melapor ke otoritas kesehatan yang bertanggung jawab. Ini termasuk tes virus corona yang dilakukan di pusat tes, di dokter Anda, di apotek Anda atau di fasilitas pemerintah - seperti sekolah. Namun, tes mandiri pribadi dikecualikan dari ini.

Informasi lebih lanjut tentang tes cepat coronavirus untuk penggunaan pribadi dapat ditemukan di tes mandiri Corona topik khusus kami.

Jika hasilnya positif, dokter mengirim sampel pasien yang sesuai ke laboratorium diagnostik khusus, yang mengonfirmasi hasilnya menggunakan tes PCR. Jika tes PCR juga positif - sampel juga dapat dikirim ke laboratorium sekuensing untuk diperiksa lebih lanjut (analisis genom sekuensing).

RKI kemudian membandingkan data pelaporan dan hasil analisis urutan secara pseudonim. Pseudonymized berarti bahwa tidak mungkin untuk menarik kesimpulan apapun tentang satu orang. Namun, informasi ini menjadi basis data bagi para ilmuwan dan pemangku kepentingan dalam sistem perawatan kesehatan untuk mendapatkan gambaran yang tepat tentang situasi pandemi saat ini. Hal ini memungkinkan penilaian situasi yang terbaik untuk (jika perlu) memperoleh langkah-langkah politik.

Apa itu analisis genom sekuensing?

Analisis genom sekuensing adalah analisis genetik terperinci. Dia memeriksa urutan yang tepat dari komponen RNA individu dalam genom virus. Ini berarti bahwa genom Sars-CoV-2, yang terdiri dari sekitar 30.000 pasangan basa, diuraikan dan kemudian dapat dibandingkan dengan tipe liar virus corona.

Hanya dengan cara ini mutasi individu dapat dikenali pada tingkat molekuler - dan penugasan dalam "pohon keluarga virus corona" dimungkinkan.

Pengurutan genom adalah proses yang memakan waktu dan mahal dengan kapasitas (sangat) terbatas. Jadi tidak setiap sampel positif dapat diurutkan secara rutin. Para ahli membuat praseleksi - jadi mereka mengambil sampel.

Hal ini juga memperjelas bahwa tidak setiap negara di dunia mampu melacak secara pasti penyebaran varian virus corona tertentu secara detail. Oleh karena itu, kemungkinan ada ketidakjelasan tertentu dalam data pelaporan yang tersedia.

Tag:  narkoba rambut kebugaran olahraga